子公司必須獨立核算，獨立申報納稅。分公司不是獨立法人，可以不獨立核算，所得稅可以在總公司合并匯算清繳。
1、企業(yè)所得稅的規(guī)定子公司應(yīng)當(dāng)單獨計算應(yīng)納稅額，在注冊地繳納稅款，并適用按月(或季)預(yù)繳、年底匯算清繳的規(guī)定。設(shè)立為分公司后，在企業(yè)所得稅的征管上執(zhí)行跨地區(qū)匯總繳納企業(yè)所得稅的規(guī)定。相關(guān)的企業(yè)所得稅審批、備案事項，子公司自行收集整理資料，向當(dāng)?shù)厮枚愔鞴芏悇?wù)機(jī)關(guān)申請。分公司應(yīng)由總機(jī)構(gòu)收集整理資料，并向總機(jī)構(gòu)所在地所得稅主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請。
2、其他稅種的影響增值稅上，根據(jù)《增值稅暫行條例》的規(guī)定：固定業(yè)戶應(yīng)當(dāng)向其機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅;總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)不在同一縣(市)的，應(yīng)當(dāng)分別向各自所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅。因此，無論設(shè)立成子公司還是分公司，都需在機(jī)構(gòu)所在地繳納增值稅。其他地稅，如房產(chǎn)稅、土地使用稅，均需在資產(chǎn)所在地納稅;而個人所得稅也應(yīng)在企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營當(dāng)?shù)乩U納。因此，無論設(shè)立成子公司還是分公司，對項目所在地的地稅基本不產(chǎn)生影響。法律依據(jù)：《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》第五十條除稅收法律、行政法規(guī)另有規(guī)定外，居民企業(yè)以企業(yè)登記注冊地為納稅地點;但登記注冊地在境外的，以實際管理機(jī)構(gòu)所在地為納稅地點。居民企業(yè)在中國境內(nèi)設(shè)立不具有法人資格的營業(yè)機(jī)構(gòu)的，應(yīng)當(dāng)匯總計算并繳納企業(yè)所得稅。《中華人民共和國增值稅暫行條例》第二十二條增值稅納稅地點：(一)固定業(yè)戶應(yīng)當(dāng)向其機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅。總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)不在同一縣(市)的，應(yīng)當(dāng)分別向各自所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅;經(jīng)國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門或者其授權(quán)的財政、稅務(wù)機(jī)關(guān)批準(zhǔn)，可以由總機(jī)構(gòu)匯總向總機(jī)構(gòu)所在地的主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報納稅。
